30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 448 aa  891    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  80.92 
 
 		 435 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1699  putative permease  51.95 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  53.38 
 
 		 455 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  47.33 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  38.5 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  38.5 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  38.5 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  38.5 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  38.5 
 
 		 426 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  37.19 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  35.84 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  31.57 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  30.52 
 
 		 453 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  26.09 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  24.69 
 
 		 476 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1565 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1565 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3982  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  23.93 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  19.94 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>