26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0970 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
415 aa  815    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  40.55 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  40.55 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  40.55 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  40.55 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  40.55 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  40.3 
 
 
426 aa  309  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
428 aa  293  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 
421 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  37.6 
 
 
408 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  35.82 
 
 
435 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  34.81 
 
 
448 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  35.39 
 
 
452 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 
446 aa  236  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  35.06 
 
 
430 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1699  putative permease  30.77 
 
 
416 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  29.31 
 
 
445 aa  188  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
455 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  28.78 
 
 
453 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  25.87 
 
 
412 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3537  major facilitator transporter  22.96 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229901  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3982  major facilitator transporter  24.6 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.28 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  24.77 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>