158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0842 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  59 
 
 
624 aa  761    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.58 
 
 
645 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  54.75 
 
 
625 aa  683    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  74.96 
 
 
628 aa  996    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  58.76 
 
 
623 aa  720    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  57.14 
 
 
626 aa  736    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.93 
 
 
629 aa  680    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  59 
 
 
621 aa  765    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  54.19 
 
 
627 aa  675    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 
629 aa  1283    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.9 
 
 
629 aa  679    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.14 
 
 
631 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  58.35 
 
 
653 aa  769    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.93 
 
 
629 aa  696    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  50.24 
 
 
640 aa  609  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  49.37 
 
 
641 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  50 
 
 
642 aa  596  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.89 
 
 
635 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.17 
 
 
679 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.59 
 
 
628 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.38 
 
 
656 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.8 
 
 
663 aa  528  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.85 
 
 
663 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.81 
 
 
639 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.6 
 
 
635 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.3 
 
 
635 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.22 
 
 
674 aa  485  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.86 
 
 
672 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.74 
 
 
673 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.2 
 
 
632 aa  465  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.04 
 
 
674 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.28 
 
 
655 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.68 
 
 
666 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.08 
 
 
676 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.16 
 
 
669 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.29 
 
 
670 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.23 
 
 
663 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.29 
 
 
679 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.99 
 
 
637 aa  351  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.25 
 
 
634 aa  350  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.75 
 
 
648 aa  350  4e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.42 
 
 
623 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.81 
 
 
695 aa  327  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.06 
 
 
707 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.39 
 
 
629 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.43 
 
 
710 aa  300  6e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  30.74 
 
 
680 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0105  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.91 
 
 
766 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  21.95 
 
 
444 aa  62.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0227  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.46 
 
 
778 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  24.66 
 
 
531 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.46 
 
 
778 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.471946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  22.63 
 
 
531 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1302  hydroxylamine reductase  25.38 
 
 
433 aa  58.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1673  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.17 
 
 
778 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0311  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.08 
 
 
779 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0423  hydroxylamine reductase  24.79 
 
 
435 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000304226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  22.91 
 
 
549 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  25 
 
 
549 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  28.64 
 
 
538 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  25.35 
 
 
557 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0858  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  24.07 
 
 
802 aa  56.2  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000764937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  23.58 
 
 
541 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0475  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  21.7 
 
 
768 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.908557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  22.91 
 
 
549 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  28.72 
 
 
552 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  26.57 
 
 
565 aa  55.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  28.09 
 
 
522 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  25.77 
 
 
533 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  24.66 
 
 
533 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  24.66 
 
 
533 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  23.81 
 
 
787 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1373  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  24.93 
 
 
786 aa  54.3  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.619711  normal  0.51907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  27.81 
 
 
535 aa  53.9  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  22.72 
 
 
553 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  25.96 
 
 
539 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  22.68 
 
 
550 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  21.51 
 
 
548 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  23.53 
 
 
549 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  24.12 
 
 
533 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2940  hydroxylamine reductase  25.9 
 
 
447 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00378374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  25.51 
 
 
550 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  22.16 
 
 
549 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  23.45 
 
 
568 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  23.92 
 
 
550 aa  51.6  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  26.49 
 
 
542 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2242  hydroxylamine reductase  28.49 
 
 
541 aa  52  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.675401  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  23.16 
 
 
525 aa  51.6  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  33.72 
 
 
550 aa  51.6  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  25.13 
 
 
547 aa  51.2  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  25 
 
 
550 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  25 
 
 
550 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  24.93 
 
 
552 aa  50.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1973  hydroxylamine reductase  33.72 
 
 
550 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  25 
 
 
550 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  25 
 
 
550 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  27.07 
 
 
537 aa  50.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1577  hydroxylamine reductase  25.38 
 
 
431 aa  50.8  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  27.23 
 
 
551 aa  50.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  26.49 
 
 
542 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>