35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0106 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 343 aa  707    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  64.2 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  62.8 
 
 		 341 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  55.56 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  53.87 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  46.82 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  43.06 
 
 		 348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  43.64 
 
 		 343 aa  258  9e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  42.77 
 
 		 331 aa  245  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  40.3 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  40.96 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  38.3 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  37.99 
 
 		 371 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  36.75 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  34.52 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 		 300 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  38.06 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  26.33 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  26.44 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  24.34 
 
 		 441 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 440 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  24.04 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  24.17 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>