30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0030 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  100 
 
 
415 aa  850    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  66.58 
 
 
427 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  63.12 
 
 
407 aa  523  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  53.22 
 
 
415 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  49.52 
 
 
425 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  48.8 
 
 
417 aa  368  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  45.19 
 
 
428 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  42.89 
 
 
431 aa  335  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  44.5 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  47.52 
 
 
423 aa  325  6e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  42.32 
 
 
460 aa  308  9e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  43.88 
 
 
420 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  38.1 
 
 
424 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  37.14 
 
 
424 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  37.62 
 
 
424 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  38.14 
 
 
446 aa  262  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  35.95 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  39.62 
 
 
481 aa  253  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  35.24 
 
 
417 aa  238  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  32.53 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  35.61 
 
 
445 aa  189  8e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  38.32 
 
 
413 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  31.59 
 
 
409 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.414005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  29.65 
 
 
443 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  42.5 
 
 
415 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  36.56 
 
 
432 aa  152  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  35.51 
 
 
415 aa  143  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  31.87 
 
 
407 aa  142  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  29.33 
 
 
318 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  27.52 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>