More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8065 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  100 
 
 
256 aa  500  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  58.82 
 
 
255 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  65.74 
 
 
260 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  54.37 
 
 
259 aa  285  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  55.2 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  52.76 
 
 
257 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  57.09 
 
 
255 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  54 
 
 
255 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  45.12 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  44.27 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  44.31 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  40.32 
 
 
243 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
239 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  41.54 
 
 
254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 
256 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  41.6 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  45.29 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  42.04 
 
 
245 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  38.96 
 
 
275 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  48 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  35.97 
 
 
251 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  35.97 
 
 
251 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  35.71 
 
 
251 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  35 
 
 
251 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  35 
 
 
251 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  35 
 
 
251 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.9 
 
 
265 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  35.71 
 
 
251 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  40.3 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  41.01 
 
 
256 aa  98.6  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  42.64 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  24.42 
 
 
333 aa  95.1  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  44.2 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  40.29 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  35 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
273 aa  88.6  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.36 
 
 
308 aa  86.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03990  expressed protein  28.62 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  38.93 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  40.71 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.51 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  40.15 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  39.23 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  34.13 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  38.76 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  41.79 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  41.22 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  39.1 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  39.1 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  39.1 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  43.16 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  38.93 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.99 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  39.84 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  35.51 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
284 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.43 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 
226 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  29 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
201 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0377  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 
225 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.790599  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
201 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 
253 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  32.06 
 
 
248 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.24 
 
 
201 aa  62.4  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  37.75 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  27.07 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  32.85 
 
 
142 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  34.35 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  32.56 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  33 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  33 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>