48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7311 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1098    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1098    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  94.95 
 
 		 555 aa  1007    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  91.34 
 
 		 554 aa  998    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  98.56 
 
 		 555 aa  1085    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2438  hypothetical protein  63.05 
 
 		 840 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  74.65 
 
 		 360 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  73.73 
 
 		 360 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  72.81 
 
 		 360 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  59.45 
 
 		 358 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  55.25 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  47.41 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  47.03 
 
 		 640 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  48.13 
 
 		 611 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  49.53 
 
 		 544 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4120  hypothetical protein  46.52 
 
 		 1371 aa  189  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  47.27 
 
 		 608 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  44.7 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  45.45 
 
 		 278 aa  174  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  45 
 
 		 278 aa  173  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  46.41 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  47.26 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  42.16 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  42.86 
 
 		 336 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1998  hypothetical protein  42.65 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  50.91 
 
 		 117 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  52.73 
 
 		 423 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  50.91 
 
 		 238 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1761  hypothetical protein  34.93 
 
 		 805 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  44.86 
 
 		 232 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5633  hypothetical protein  34.23 
 
 		 866 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  48 
 
 		 243 aa  86.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  39.81 
 
 		 235 aa  82.8  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  45.95 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  42.48 
 
 		 150 aa  76.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  37.24 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  45.56 
 
 		 152 aa  66.6  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  42.15 
 
 		 235 aa  65.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  38.14 
 
 		 240 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  28.85 
 
 		 118 aa  54.3  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  26.92 
 
 		 117 aa  52.8  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1065 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  38.98 
 
 		 341 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0600  hypothetical protein  34.29 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5249  methylation  33.33 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  29.33 
 
 		 590 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5442  hypothetical protein  34.52 
 
 		 507 aa  43.9  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103893  normal  0.133635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>