123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6096 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 276 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  93.84 
 
 		 276 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  85.45 
 
 		 276 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  73.26 
 
 		 276 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  72.53 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  71.53 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  69.74 
 
 		 273 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  70.59 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  68.5 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  68.86 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  68.86 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  68.13 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  67.74 
 
 		 277 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  66.04 
 
 		 272 aa  347  9e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  62.01 
 
 		 281 aa  329  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  62.01 
 
 		 281 aa  329  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  61.31 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  56.95 
 
 		 152 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  55.48 
 
 		 152 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  41.13 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  53.38 
 
 		 182 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  59.85 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  59.85 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  59.85 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  59.85 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  59.85 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  59.85 
 
 		 142 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  59.85 
 
 		 142 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  51.35 
 
 		 157 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  51.35 
 
 		 157 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  52.03 
 
 		 157 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  53.85 
 
 		 143 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  55.07 
 
 		 140 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  50.66 
 
 		 285 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  47.33 
 
 		 150 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  48.61 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  51.35 
 
 		 156 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  47.71 
 
 		 155 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  45.83 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.67 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  53.91 
 
 		 128 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  44.93 
 
 		 144 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  34.48 
 
 		 146 aa  91.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  31.67 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  35.8 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  35.8 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  31.71 
 
 		 363 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  31.73 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  40.43 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  37.34 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  34.36 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  33.33 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  36.36 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  30.29 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  37.11 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  37.11 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  36.31 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  37.11 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  36.31 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  37.11 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  37.86 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  33.33 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  30.65 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  36.48 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  27.03 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  33.75 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  36.3 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  34.39 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  34.38 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  36 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  34.38 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  35.37 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  33.72 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  35.57 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  33.14 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  31.41 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  36.3 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  41.18 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 106 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 125 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 115 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 		 98 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 		 98 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  36.28 
 
 		 116 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  38.1 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  31.71 
 
 		 538 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 113 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2448  rhodanese-like protein  36.7 
 
 		 123 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 223 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 528 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 161 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  32 
 
 		 379 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  31.73 
 
 		 113 aa  45.4  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  32.32 
 
 		 103 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.5 
 
 		 109 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 111 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>