60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5382 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  100 
 
 
254 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  87.35 
 
 
257 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  66.14 
 
 
259 aa  334  9e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  65.34 
 
 
258 aa  333  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  64.94 
 
 
258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  61.51 
 
 
256 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  58.63 
 
 
262 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  58.8 
 
 
289 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  59.59 
 
 
258 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  55.87 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  58.2 
 
 
292 aa  265  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  55.6 
 
 
275 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  54.44 
 
 
255 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  53.78 
 
 
276 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  50.8 
 
 
253 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  48.06 
 
 
264 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  47.77 
 
 
253 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  47.27 
 
 
264 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  46.9 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  44.62 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  42.69 
 
 
251 aa  185  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  44.09 
 
 
288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  38.52 
 
 
312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.55 
 
 
587 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  37.7 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  34.54 
 
 
245 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  34.26 
 
 
252 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  30.57 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  33.46 
 
 
249 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  28.1 
 
 
302 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  28.1 
 
 
302 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  32 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  30.8 
 
 
247 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  31.6 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  29.22 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  26.14 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  27.05 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  30.32 
 
 
259 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  27.41 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  28.93 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  28.57 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  27.34 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  26.45 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  26.53 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  27.31 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  25.09 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  25.09 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  26.82 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  37.31 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  33.04 
 
 
366 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  25.82 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  27.73 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  24.29 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  26.9 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0337  MOSC domain containing protein  26.21 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4117  MOSC-like beta barrel  31.17 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  28.62 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4249  MOSC domain-containing protein  31.17 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270492  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  32.79 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  25.53 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>