65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3594 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3594  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 380 aa  753    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1541  methyltransferase, putative  52.29 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0775006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0869  putative cytosine-specific methyltransferase protein  70.3 
 
 		 194 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0279649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2321  C-5 cytosine-specific DNA methylase  65.22 
 
 		 287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0665  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.63 
 
 		 446 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.42 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3531  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  39.42 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3814  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  39.42 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.96 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  35.19 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  27.98 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  35.19 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.56 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.29 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.28 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  31.37 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.29 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  33.65 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  34.31 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  31.37 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 		 359 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  34.02 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  33.64 
 
 		 652 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  26.38 
 
 		 657 aa  50.8  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  34.78 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  46.81 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  28.48 
 
 		 500 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.58 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  28.12 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6177  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 		 671 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  46.81 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 		 727 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 		 319 aa  47  0.0005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28 
 
 		 362 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  30.77 
 
 		 395 aa  46.6  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3182  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.11 
 
 		 495 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  32.61 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  33.68 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  25.65 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.57 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.17 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3372  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.11 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  24.64 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.9 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.04 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 		 342 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  25.38 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.9 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  30.34 
 
 		 355 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  29.11 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0979  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.17 
 
 		 484 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.441427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  42.22 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.06 
 
 		 328 aa  43.1  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>