More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3558 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3558  NusG antitermination factor  100 
 
 		 178 aa  357  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  32.24 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  32.24 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  32.22 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  30.6 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  30.6 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  32.22 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  30.27 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  30.6 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  32.26 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  30.27 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  30.77 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  29.67 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  32.24 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  29.67 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  30.22 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  31.72 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  31.89 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  31.72 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  31.72 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  29.12 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  29.12 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  28.96 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  27.78 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  30.17 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  28.96 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  32.43 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  29.83 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  29.83 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  27.07 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  28.49 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  30.69 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  26.78 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  29.51 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  29.28 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  28.42 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  28.42 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  28.42 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  28.42 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  27.68 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  27.68 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  27.62 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  29.03 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  29.03 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  29.03 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  28.42 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  27.87 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  28.49 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  29.44 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  28.42 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  26.67 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  29.12 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0593  NusG antitermination factor  29.57 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6676  hypothetical protein  30.64 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  28.26 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  28.26 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  27.93 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  28.26 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  28.73 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  28.26 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  25.41 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  28.73 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  28.65 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  29.19 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  24.32 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  27.72 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1549  transcription antitermination protein nusG  25.65 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  25.54 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  25.68 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  27.72 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  27.72 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  30.34 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  27.47 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  27.22 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  27.32 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2112  transcription antitermination protein NusG  29.9 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000834658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  27.03 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  29.79 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  28.96 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  28.96 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  28.8 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  28.96 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  26.37 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  28.96 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  28.96 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  25.82 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  30.22 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  28.11 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  27.03 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  29.73 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1046  NusG antitermination factor  26.6 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  27.57 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  28.11 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  26.88 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06110  transcription termination/antitermination factor NusG  28.95 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  28.42 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  27.32 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  27.03 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  28.11 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>