231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3519 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
236 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  43.88 
 
 
243 aa  201  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  47.44 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  40.51 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  43.59 
 
 
251 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  39.57 
 
 
230 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  36.82 
 
 
244 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  36.82 
 
 
244 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  37.5 
 
 
244 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  41.28 
 
 
225 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  37.83 
 
 
240 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  35.98 
 
 
243 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  41.12 
 
 
225 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  38.82 
 
 
233 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  40.65 
 
 
225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  38.89 
 
 
237 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  40.72 
 
 
238 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  35.62 
 
 
240 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  35.19 
 
 
242 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  34.75 
 
 
242 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  35.98 
 
 
240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  35.56 
 
 
240 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  34.89 
 
 
241 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  35.04 
 
 
232 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  32.48 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  38.27 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  37.95 
 
 
236 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  34.33 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  32.63 
 
 
232 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  33.05 
 
 
232 aa  128  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  34.21 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 
244 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  30.6 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  29.79 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  31.98 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  27.14 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  30.69 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  28.02 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  25.88 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  31.9 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  29.19 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  32.52 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  29.59 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  25.41 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  29.14 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  35.4 
 
 
258 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  30.77 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  26.45 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  28.48 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  31.34 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  29.49 
 
 
301 aa  63.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  30.83 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  28.26 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  31.58 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  32.12 
 
 
505 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  25.51 
 
 
238 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  26.39 
 
 
357 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  26.09 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  27.66 
 
 
258 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  29.3 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  27.89 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  23.19 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  24.64 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  29.24 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  28.89 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  31.39 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  25.37 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  27.08 
 
 
229 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  28.82 
 
 
312 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  30.28 
 
 
233 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  27.27 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  29.76 
 
 
250 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  26.95 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  26.09 
 
 
236 aa  55.5  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  28.07 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  28.76 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  24.75 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  23.91 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  26.29 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  32.11 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  28 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  28.3 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  25.26 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  28.4 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  29.76 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  30.2 
 
 
249 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  28.26 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  35.56 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  29.55 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  29.17 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  26.6 
 
 
188 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  27.39 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  29.55 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  29.55 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  29.55 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  29.55 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>