78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4583 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  80.6 
 
 
68 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  80 
 
 
71 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  67.19 
 
 
68 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  59.68 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 
63 aa  57  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  45.9 
 
 
64 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  45.9 
 
 
64 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  45.9 
 
 
64 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  41.67 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  40.32 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  44.26 
 
 
64 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.27 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.27 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.27 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  37.5 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.94 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  42.62 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  40.98 
 
 
64 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  45.45 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  41.27 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  41.94 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  43.33 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  41.94 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  35 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  41.94 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  38.33 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  38.71 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  38.71 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  38.71 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  32.81 
 
 
505 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  35.94 
 
 
551 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  35.48 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  39.68 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  40 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  40 
 
 
64 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  34.85 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  38.1 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  35.48 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  40.98 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  39.06 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  41.67 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  33.9 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  33.9 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  36.21 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  38.81 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  39.06 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  35.38 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  33.9 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  40.62 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  37.1 
 
 
349 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  39.06 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  35.38 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  36.07 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  34.29 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  36.07 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  36.07 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  33.9 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  36.67 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  31.67 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  31.67 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  35.09 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  31.67 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  33.85 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2133  protein of unknown function DUF1271  35.21 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.71 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.59 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  36.21 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  31.67 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  35 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  38.98 
 
 
101 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  36.51 
 
 
65 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  38.71 
 
 
69 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>