292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2867 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  203  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  203  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  203  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  58.42 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  56.6 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  54.21 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  47.57 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  54.21 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  51.46 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  50.54 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  45.92 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  45.92 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  51.89 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  52.04 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  52.04 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  52.04 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  52.44 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.14 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  45.1 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.14 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  42.57 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  44.04 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  45.28 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  41.18 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  44.66 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  49.46 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  45.54 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  41.58 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  41.58 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  41.58 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65990  SMR multidrug efflux transporter  46.53 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00317706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  39.6 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  39.6 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5725  SMR multidrug efflux transporter  45.54 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  40.59 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  40.59 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  37 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  40.59 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  45.98 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  45.98 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  37 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  42.27 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  42.27 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2205  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  45.19 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  45.19 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  45.19 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>