235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3314 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
344 aa  698    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  49.84 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3094  hypothetical protein  49.08 
 
 
337 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.815715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0511  beta-lactamase-like  48.14 
 
 
324 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  48.11 
 
 
353 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0356  twin-arginine translocation pathway signal  47.63 
 
 
353 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  47.02 
 
 
362 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  47.29 
 
 
329 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1210  hypothetical protein  48.61 
 
 
358 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00957617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4200  hypothetical protein  47.58 
 
 
331 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  47.02 
 
 
361 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2411  beta-lactamase domain-containing protein  46.38 
 
 
353 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1801  beta-lactamase domain protein  47.35 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  46.2 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0369  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  45.77 
 
 
330 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  45.69 
 
 
352 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  45.61 
 
 
353 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  47.84 
 
 
353 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  48.61 
 
 
353 aa  275  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0557  hypothetical protein  43.62 
 
 
334 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.653533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  46.34 
 
 
328 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  44.14 
 
 
336 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  46.01 
 
 
332 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  41.98 
 
 
336 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  41.18 
 
 
335 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  45.71 
 
 
332 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  44.08 
 
 
344 aa  252  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  44.88 
 
 
325 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  44.79 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  42.35 
 
 
354 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  45.66 
 
 
362 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  37.42 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  40.31 
 
 
329 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  40.31 
 
 
342 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  40.31 
 
 
342 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  36.31 
 
 
357 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  41.47 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  34.53 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  39.92 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  41.35 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  38.6 
 
 
388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  39.53 
 
 
356 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  40.36 
 
 
324 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.85 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  43.04 
 
 
368 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  39.91 
 
 
324 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  38.73 
 
 
372 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  37.15 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  39.91 
 
 
423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  39.46 
 
 
324 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  39.46 
 
 
324 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  39.46 
 
 
324 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  40.36 
 
 
324 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  40.53 
 
 
372 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  39.46 
 
 
324 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  40.53 
 
 
372 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  41.84 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  40.53 
 
 
372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  40.36 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.35 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  37.79 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  36.96 
 
 
361 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  36.74 
 
 
386 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  36.36 
 
 
335 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  36.53 
 
 
367 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.66 
 
 
376 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.75 
 
 
374 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0514  outer membrane protein  35.56 
 
 
398 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  38.33 
 
 
409 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  35.79 
 
 
365 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.75 
 
 
374 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  38.96 
 
 
358 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  38.96 
 
 
350 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  34.28 
 
 
336 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  40.09 
 
 
363 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.92 
 
 
374 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  38.93 
 
 
358 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  36.18 
 
 
376 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  32.13 
 
 
364 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  32.78 
 
 
371 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.43 
 
 
353 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  38.33 
 
 
374 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.88 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  37.5 
 
 
374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  37.5 
 
 
374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  36.11 
 
 
366 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  35 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  40.09 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  35.31 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  34.96 
 
 
356 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  33.02 
 
 
369 aa  152  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  37.34 
 
 
383 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  30.37 
 
 
377 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  37.19 
 
 
318 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  38.78 
 
 
367 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  36.4 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  37.66 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  39.22 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>