More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0629 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0629  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 308 aa  630  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  50.83 
 
 		 312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2364  response regulator receiver modulated CheW protein  45.18 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2225  response regulator receiver modulated CheW protein  43.2 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  36.36 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  35.58 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  36.01 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  36.04 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  35.86 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  36.1 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  35.71 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  35.37 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  35.39 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  37.9 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  34.42 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  35.06 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  34.73 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  34.3 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  34.3 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  35.97 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  34.3 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  34.3 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  36.75 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  34.88 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  35.6 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  34.42 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  33.88 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  36.13 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  35.48 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  34.65 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  33.87 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  35.74 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  35.96 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  35.2 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  35.45 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  36.31 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  33.99 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  34.08 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  35.28 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  34.94 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  35.58 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  33.77 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  34.41 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  37.21 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  35.58 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  34.41 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  32.38 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  34.52 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  34.43 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  34.42 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  34.42 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  34.09 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  34.42 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  34.1 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  32.89 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  32.13 
 
 		 308 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  32.13 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  33.44 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  31.75 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  31.31 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  37.13 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  33.12 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  33.55 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  31.75 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  30.67 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  33.12 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  34.89 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  31.75 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  31.11 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  31.43 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  31.11 
 
 		 314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  31.11 
 
 		 314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  31.11 
 
 		 314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  31.83 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  34.22 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  31.75 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  32.28 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  31.43 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  33.02 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  31.13 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  30.97 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  34.97 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  34.19 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  33.23 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  30.6 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  29.75 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  29.75 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  29.72 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  29.72 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  32.8 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  30.25 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  31.33 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  31.33 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2499  CheW protein  29.43 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  32.2 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1763  putative CheW protein  32.6 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3759  response regulator receiver modulated CheW protein  33.65 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00050568  normal  0.01011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  29.52 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  29.75 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>