134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1429 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  92.09 
 
 
253 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  92.89 
 
 
253 aa  490  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  71.03 
 
 
254 aa  392  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  59.68 
 
 
254 aa  300  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  35.94 
 
 
251 aa  168  9e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  32.82 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  31.03 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  30.15 
 
 
262 aa  123  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  28.69 
 
 
291 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  28.03 
 
 
310 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  28.46 
 
 
328 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  26.52 
 
 
328 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  29.25 
 
 
307 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  29.96 
 
 
287 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  27.91 
 
 
277 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  26.56 
 
 
277 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  27.48 
 
 
303 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  27.91 
 
 
342 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  27.38 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  27.27 
 
 
380 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  26.32 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  28.24 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  28.19 
 
 
267 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  24.74 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  26.63 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  24.49 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  23.94 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0124  TatD family hydrolase  43.24 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  32.12 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  23.79 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  31.33 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  26.85 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  25.85 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  29.45 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0199  TatD family protein  37.66 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  25.49 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  29.93 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  32.89 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  27.33 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  32.89 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  28.68 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  32.89 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  28.68 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  28.68 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  32.89 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  29.45 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  27.59 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  35.37 
 
 
253 aa  48.9  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  30.56 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  31.73 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  28.28 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  38.16 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  28.38 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  35.82 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  30.49 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  31.4 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  35.82 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  31.4 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  30.49 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  30.49 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  30.49 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2730  TatD family hydrolase  34.48 
 
 
257 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000196436  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  35.82 
 
 
266 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  31.58 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  31.43 
 
 
268 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  26.39 
 
 
280 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  27.93 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  35.53 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  30.94 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  26.92 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  27.5 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  32.95 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  42.11 
 
 
258 aa  46.2  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  40.51 
 
 
254 aa  45.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  22.12 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  26.86 
 
 
454 aa  46.2  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  27.34 
 
 
464 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  30.67 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  24.19 
 
 
225 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  31.11 
 
 
265 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  28.44 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  30.23 
 
 
255 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  36.49 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  27.11 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  33.7 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl048  Mg2+ dependent DNAse  33.72 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  34.25 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  28.93 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  28.93 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  27.94 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  31.71 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  23.04 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  30 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  31.11 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  34.67 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  30.15 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  25 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  24.83 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  24.57 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.76474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>