70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1014 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1014  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  709    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1667  hypothetical protein  92.57 
 
 
350 aa  634    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0932  hypothetical protein  94.57 
 
 
350 aa  648    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1204  hypothetical protein  76.88 
 
 
354 aa  559  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1157  hypothetical protein  70 
 
 
351 aa  489  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00693475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  27.2 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  24.69 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  23.97 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  22.86 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  24.25 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  22.82 
 
 
341 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  24.69 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  27.53 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  21.67 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  25.4 
 
 
368 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  22.13 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  21.98 
 
 
345 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  27.67 
 
 
329 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  22.04 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  23.72 
 
 
353 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  27.01 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  19.91 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  29.34 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  25.24 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  25.24 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  22.14 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  23.83 
 
 
328 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 
515 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1674  hypothetical protein  22.87 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 
394 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  23.44 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  28.48 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  26.59 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  27.98 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  24.56 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  25.32 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  26.11 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  28.48 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  25.58 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
396 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  23.32 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  26.29 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  23.6 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  28.57 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  23.6 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  23.89 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  23.91 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  27.01 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  26.44 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  20.12 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  25.43 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 
331 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  22.6 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  21.48 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  27.75 
 
 
311 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  21.69 
 
 
364 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  25.43 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  26.32 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  28.87 
 
 
361 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  22.31 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  23.19 
 
 
361 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  23.73 
 
 
352 aa  43.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  20.37 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  21.79 
 
 
360 aa  42.7  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  22.67 
 
 
354 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  21.43 
 
 
339 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>