More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1597 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1597  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1231    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000203225  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  60.33 
 
 		 606 aa  726    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0532  hypothetical protein  91.04 
 
 		 614 aa  1102    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.26777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0315  hypothetical protein  94.14 
 
 		 614 aa  1136    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.463593 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  41.98 
 
 		 632 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0873  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.34 
 
 		 550 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0794  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.24 
 
 		 553 aa  137  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000691143 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0963  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.3 
 
 		 640 aa  134  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.62 
 
 		 628 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1960  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.16 
 
 		 557 aa  128  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1658  ATP-dependent protease La  32.77 
 
 		 307 aa  90.9  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  35.4 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  33.93 
 
 		 787 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  26.83 
 
 		 797 aa  62  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  33.93 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  31.58 
 
 		 880 aa  60.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  30.5 
 
 		 815 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  28.14 
 
 		 779 aa  57.8  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1954  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.7 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  35.63 
 
 		 804 aa  57.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  31.11 
 
 		 809 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 808 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  36.26 
 
 		 652 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  27.93 
 
 		 820 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  30.6 
 
 		 856 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  31.68 
 
 		 537 aa  55.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  29.63 
 
 		 898 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  35 
 
 		 558 aa  54.7  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  31.21 
 
 		 558 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  28 
 
 		 787 aa  53.9  0.000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  32.08 
 
 		 810 aa  53.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  25.53 
 
 		 779 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  29.09 
 
 		 875 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  29.53 
 
 		 815 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  32.67 
 
 		 639 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  29.09 
 
 		 874 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  32.61 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  32.61 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  34.94 
 
 		 790 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  29 
 
 		 806 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  27.83 
 
 		 807 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1211  ATP-dependent protease La  26.7 
 
 		 817 aa  51.6  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  30.28 
 
 		 774 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  32.14 
 
 		 809 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  26.5 
 
 		 804 aa  51.6  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  30.52 
 
 		 812 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  29 
 
 		 806 aa  52  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  31.43 
 
 		 775 aa  51.2  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  29.37 
 
 		 786 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  44.62 
 
 		 338 aa  51.2  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  32 
 
 		 778 aa  51.6  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  24.88 
 
 		 825 aa  51.2  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 815 aa  50.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  32.84 
 
 		 820 aa  50.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  32.05 
 
 		 818 aa  50.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  31.65 
 
 		 810 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.22 
 
 		 348 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  32.05 
 
 		 812 aa  50.4  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  28.03 
 
 		 810 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 1309 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  26.53 
 
 		 808 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  38.46 
 
 		 342 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  27.86 
 
 		 780 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  29.55 
 
 		 800 aa  50.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  27.12 
 
 		 807 aa  50.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 859 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  28.57 
 
 		 570 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 788 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0317  ATP-dependent protease La  30.85 
 
 		 817 aa  49.7  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  25.6 
 
 		 812 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  29.37 
 
 		 783 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  29.55 
 
 		 810 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  32.77 
 
 		 815 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  29.59 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0764  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 774 aa  49.7  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  23.48 
 
 		 802 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.66 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  27.55 
 
 		 802 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  31.52 
 
 		 793 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  26.5 
 
 		 796 aa  48.9  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  27.43 
 
 		 823 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 805 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  21.64 
 
 		 799 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  31.06 
 
 		 816 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 806 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  32.5 
 
 		 570 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  35.9 
 
 		 353 aa  48.5  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  36.07 
 
 		 783 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  27.07 
 
 		 670 aa  48.9  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.72 
 
 		 784 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  28.72 
 
 		 817 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  28.72 
 
 		 816 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  36.92 
 
 		 383 aa  48.9  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  27 
 
 		 799 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  32.98 
 
 		 807 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  28.75 
 
 		 698 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  29.47 
 
 		 806 aa  48.5  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  29.57 
 
 		 792 aa  48.5  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  36.07 
 
 		 783 aa  48.5  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0390  ATP-dependent protease La  30.21 
 
 		 800 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.754053  normal  0.273215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>