More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1544 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1544  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 438 aa  889    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0446  radical SAM domain-containing protein  74.03 
 
 		 439 aa  646    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.627124  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0461  radical SAM domain-containing protein  94.75 
 
 		 438 aa  825    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  92.69 
 
 		 438 aa  810    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1454  radical SAM domain-containing protein  58.43 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 		 544 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  32.89 
 
 		 559 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 		 544 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 566 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 557 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 545 aa  216  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 557 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  29.34 
 
 		 557 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 812 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 		 589 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 613 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 		 589 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 563 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  28.05 
 
 		 589 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 828 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 624 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  29.74 
 
 		 842 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 599 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 599 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 593 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 613 aa  200  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 826 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 626 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 563 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  27.8 
 
 		 573 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  27.21 
 
 		 544 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  26.95 
 
 		 510 aa  190  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  29.07 
 
 		 618 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.95 
 
 		 860 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 		 619 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 852 aa  189  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 864 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 842 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 597 aa  187  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 828 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  29.42 
 
 		 537 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  29.42 
 
 		 537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 		 817 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  28.51 
 
 		 540 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 828 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 		 633 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 617 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  26.44 
 
 		 897 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 538 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 		 614 aa  179  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 543 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 553 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 657 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 619 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  30.21 
 
 		 617 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 537 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 551 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  30.21 
 
 		 617 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  27.17 
 
 		 638 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  30.42 
 
 		 613 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 519 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  29.47 
 
 		 836 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  28.19 
 
 		 626 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  28.94 
 
 		 600 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 483 aa  170  5e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 849 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  27.21 
 
 		 532 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 654 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 600 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 653 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.04 
 
 		 546 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 628 aa  166  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 640 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 897 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  28.6 
 
 		 591 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  26.31 
 
 		 626 aa  164  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0161  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 469 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 661 aa  163  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1639  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 803 aa  162  9e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 611 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  27.63 
 
 		 898 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 627 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 898 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 898 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 610 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 663 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  25 
 
 		 636 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  28.1 
 
 		 898 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 922 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  26.28 
 
 		 879 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 655 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 663 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  29.8 
 
 		 640 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.28 
 
 		 894 aa  156  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  26.34 
 
 		 842 aa  156  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.9 
 
 		 887 aa  156  8e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0354  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  26.3 
 
 		 910 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>