42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1695 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  97.6 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  95.6 
 
 		 250 aa  485  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  89.2 
 
 		 249 aa  449  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  64.94 
 
 		 247 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  32.02 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  29.92 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  31.5 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32.81 
 
 		 242 aa  123  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  34.12 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.74 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.24 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  30.08 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  32 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  30.74 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  30.23 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  30.86 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  29.92 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.91 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  28.57 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  27.17 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  28.52 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.32 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  28.52 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  25.81 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  28.46 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.91 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  28.12 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  27.02 
 
 		 265 aa  99.4  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.1 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  26.51 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.25 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  28.05 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  24.9 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  24.16 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  23.01 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  22.36 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  24.71 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  23.32 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  23.35 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  20.09 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  20.76 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>