230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1401 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 232 aa  477  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  98.71 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  98.28 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  88.79 
 
 		 234 aa  441  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  84.05 
 
 		 236 aa  412  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  62.93 
 
 		 232 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  62.5 
 
 		 232 aa  317  7.999999999999999e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  51.09 
 
 		 230 aa  249  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  50.89 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  49.33 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  47.09 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  45.29 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  46.19 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  46.88 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  45.54 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  43.75 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  43.95 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  44.64 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  44.2 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  45.09 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  45.29 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  46.19 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  42.86 
 
 		 259 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  43.3 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  42.86 
 
 		 228 aa  208  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  43.78 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  42.48 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  43.36 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  42.92 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  42.22 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  42.67 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  39.56 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  27.62 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  27.6 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  27.69 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  31.77 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  29.69 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  26.16 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  25.58 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  24.19 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  27.57 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  31.18 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  27.13 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  25.14 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  29.57 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  28.95 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  27.65 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  26.74 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  26.74 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  26.16 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  28.29 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  30.73 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  30.32 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  31.18 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  30.11 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  27.98 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  27.36 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  27.36 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  26.42 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  26.42 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  27.36 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  30.2 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  29.17 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  28.19 
 
 		 296 aa  52  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  28.49 
 
 		 284 aa  51.6  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  27.89 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  27.53 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  27.53 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  23.44 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  25.43 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  30.53 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  27.63 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  31.76 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  30.46 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  27.07 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  24.49 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  33.11 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  27.87 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  26.42 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  26.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  31.08 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  29.05 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  23.5 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  26.97 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  31.76 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  27.42 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  31.76 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  30.2 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  29.74 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 		 280 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  30.67 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  28.49 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0585  urease accessory protein UreG  31.01 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.084211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  31.08 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  27.96 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  25.91 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0058  urease accessory protein UreG  25.65 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  23.3 
 
 		 278 aa  48.5  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  27.6 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0335  hydrogenase accessory protein HypB  24.18 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.734472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>