240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0820 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  59.76 
 
 
1727 aa  2021    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  51.06 
 
 
1551 aa  1548    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  31.76 
 
 
1366 aa  679    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.7 
 
 
1442 aa  731    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.83 
 
 
1504 aa  799    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  38.97 
 
 
1538 aa  852    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  100 
 
 
1738 aa  3568    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.93 
 
 
1750 aa  818    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  38.65 
 
 
1812 aa  891    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  34.4 
 
 
1340 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  41.98 
 
 
2110 aa  1021    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  43.86 
 
 
2168 aa  1061    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  37.7 
 
 
1579 aa  855    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  53.18 
 
 
1801 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  32.25 
 
 
1323 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  53.02 
 
 
1800 aa  569  1e-160  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  31.17 
 
 
1281 aa  569  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  31.26 
 
 
1281 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  28.39 
 
 
1318 aa  562  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  30.93 
 
 
1336 aa  545  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  31.34 
 
 
1300 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.28 
 
 
1259 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  29.27 
 
 
1302 aa  475  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  28.78 
 
 
1258 aa  476  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  29.85 
 
 
1298 aa  474  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  29.23 
 
 
1256 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  27.85 
 
 
1426 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  27.09 
 
 
1255 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  27.71 
 
 
1244 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  29.2 
 
 
1205 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  29.5 
 
 
1194 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  31.65 
 
 
1198 aa  453  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  31.65 
 
 
1198 aa  453  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  31.65 
 
 
1198 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  29.63 
 
 
1213 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  28.66 
 
 
1220 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  28.29 
 
 
1237 aa  446  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  27.3 
 
 
1206 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  27.84 
 
 
1263 aa  443  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  27.44 
 
 
1222 aa  443  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  28.58 
 
 
1222 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  28.21 
 
 
1207 aa  443  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  29.04 
 
 
1196 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  27.84 
 
 
1435 aa  443  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  27.52 
 
 
1406 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  28.02 
 
 
1266 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  29.64 
 
 
1191 aa  439  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  28.81 
 
 
1209 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  29.43 
 
 
1193 aa  437  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  28.04 
 
 
1409 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  29.72 
 
 
1199 aa  433  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  27.42 
 
 
1238 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  28.13 
 
 
1330 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  30.5 
 
 
1190 aa  430  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  29.21 
 
 
1187 aa  425  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  28.44 
 
 
1288 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  27.26 
 
 
1270 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  26.5 
 
 
1273 aa  426  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  26.87 
 
 
1267 aa  427  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  27.34 
 
 
1267 aa  425  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  29.01 
 
 
1203 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  29.31 
 
 
1187 aa  425  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  27.35 
 
 
1247 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  28.65 
 
 
1207 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  27.62 
 
 
1261 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  27.76 
 
 
1341 aa  422  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  27.05 
 
 
1290 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  27.48 
 
 
1336 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  27.85 
 
 
1329 aa  422  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  27.21 
 
 
1270 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  28.55 
 
 
1212 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  28.54 
 
 
1253 aa  420  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  27.05 
 
 
1269 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  27.31 
 
 
1269 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  29.01 
 
 
1242 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  28.67 
 
 
1266 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  27.91 
 
 
1339 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  27.43 
 
 
1300 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  27.23 
 
 
1336 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  27.73 
 
 
1244 aa  414  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  26.27 
 
 
1269 aa  417  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  29.31 
 
 
1261 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  28.24 
 
 
1328 aa  417  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  27.1 
 
 
1269 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  26.27 
 
 
1269 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  30.18 
 
 
1457 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  26.27 
 
 
1269 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  27.75 
 
 
1335 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  28.33 
 
 
1333 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  28.11 
 
 
1293 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  28.29 
 
 
1347 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  27.88 
 
 
1337 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  27.1 
 
 
1328 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  26.52 
 
 
1285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  27.71 
 
 
1330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  27.59 
 
 
1283 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  27.71 
 
 
1330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  28.61 
 
 
1192 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  27.74 
 
 
1337 aa  410  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  27.5 
 
 
1245 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>