46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2444 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  279  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  40.35 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  34.15 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  37.29 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  46.59 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  33.94 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  36.21 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  35.34 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  33.94 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  35.34 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  32.76 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  36.51 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  39.77 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  36.51 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  37.27 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  35.46 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  44.29 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  43.75 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  41.98 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  40.48 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  41.03 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  33.86 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  38.96 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  39.02 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  30.97 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  39.51 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  34.31 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  32.43 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  31.75 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  38.18 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  32.81 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  33.65 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  31.25 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  31.25 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  34.38 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  28.1 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  33.75 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  37.5 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  31.82 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  35.29 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2054  hypothetical protein  27.83 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2088  hypothetical protein  25.22 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2540  putative cell division protein ZapA  36.51 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  27.73 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>