41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2088 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2088  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  265  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0174  protein of unknown function DUF710  59.4 
 
 
145 aa  146  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0545  protein of unknown function DUF710  39.23 
 
 
231 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0821  cell division protein ZapA  46.34 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0542  protein of unknown function DUF710  48.05 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0424  protein of unknown function DUF710  54.84 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1335  hypothetical protein  38.06 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372758  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1850  hypothetical protein  43.48 
 
 
451 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2635  cell division protein ZapA  43.68 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000609158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2138  hypothetical protein  43.48 
 
 
451 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.153267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1633  hypothetical protein  45.68 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2394  protein of unknown function DUF710  38.1 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.442837  normal  0.759289 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1104  hypothetical protein  43.04 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4668  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000339747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0573  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000110246  normal  0.416241 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4665  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0691455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4681  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000196788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4383  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3243  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4681  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00233612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4450  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000527934  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4288  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000107363  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4299  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000161047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4797  cell division protein ZapA  44.29 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000729346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1749  hypothetical protein  35.71 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0526906  normal  0.375639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1815  protein of unknown function DUF710  36.11 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.441176  normal  0.49236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0221  protein of unknown function DUF710  43.02 
 
 
85 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1338  protein of unknown function DUF710  33.33 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0724  hypothetical protein  34.12 
 
 
88 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2128  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2048  hypothetical protein  39.36 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05650  hypothetical protein  34.41 
 
 
120 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1200  hypothetical protein  36.96 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1222  hypothetical protein  36.96 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  31.33 
 
 
97 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0720  hypothetical protein  30.12 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  34.65 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  25.22 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  28.71 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0713  hypothetical protein  27.37 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.176379  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  30.3 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>