24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2138 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2138  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  822    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.153267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1850  hypothetical protein  98.23 
 
 		 451 aa  806    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  28.19 
 
 		 1621 aa  65.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2088  hypothetical protein  43.48 
 
 		 136 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0545  protein of unknown function DUF710  31.1 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0174  protein of unknown function DUF710  38.04 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  23.34 
 
 		 783 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1633  hypothetical protein  44.29 
 
 		 90 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2394  protein of unknown function DUF710  42.03 
 
 		 102 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.442837  normal  0.759289 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1338  protein of unknown function DUF710  32.52 
 
 		 163 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1104  hypothetical protein  38.57 
 
 		 107 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0542  protein of unknown function DUF710  40 
 
 		 85 aa  50.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0863  hypothetical protein  30.81 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 		 657 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0821  cell division protein ZapA  36.23 
 
 		 91 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 1356 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1815  protein of unknown function DUF710  38.57 
 
 		 100 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.441176  normal  0.49236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1749  hypothetical protein  40.79 
 
 		 91 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0526906  normal  0.375639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0720  hypothetical protein  35.9 
 
 		 119 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2635  cell division protein ZapA  34.29 
 
 		 87 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000609158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2128  hypothetical protein  34.29 
 
 		 95 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0424  protein of unknown function DUF710  39.34 
 
 		 157 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.46 
 
 		 726 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.386076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1378  hypothetical protein  24.56 
 
 		 287 aa  44.3  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>