18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0713 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0713  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  189  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.176379  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0116  protein of unknown function DUF710  39.53 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0720  hypothetical protein  32.22 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2352  hypothetical protein  30.59 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.65824e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0424  protein of unknown function DUF710  32.79 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2394  protein of unknown function DUF710  26.87 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.442837  normal  0.759289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  31.91 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0542  protein of unknown function DUF710  31.25 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  37.21 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  35.38 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  35.38 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2088  hypothetical protein  27.37 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  35.38 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  35.38 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  35.38 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  35.38 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  35.38 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  29.67 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>