188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0525 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0525  response regulator receiver protein  100 
 
 		 277 aa  552  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.545244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  35.42 
 
 		 182 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  32.95 
 
 		 181 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  32.57 
 
 		 181 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  33.57 
 
 		 181 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 181 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.73 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  34.51 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 183 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0661  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  30.34 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 158 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  30.47 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4001  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  26.62 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1326 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.94 
 
 		 634 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  27.87 
 
 		 121 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 131 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 183 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 126 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1406  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0498648  hitchhiker  0.0000919549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 452 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  25 
 
 		 127 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 126 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  29.41 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  27.5 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3251  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.35 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61058  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  25.83 
 
 		 126 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  21.99 
 
 		 139 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  25.83 
 
 		 130 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  21.67 
 
 		 127 aa  50.4  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  26.02 
 
 		 129 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  25.64 
 
 		 127 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 395 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  25 
 
 		 127 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 127 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 127 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 		 137 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  25.71 
 
 		 127 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 452 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  25 
 
 		 127 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  25.83 
 
 		 130 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  25.83 
 
 		 122 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  25 
 
 		 133 aa  49.7  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  29.63 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  24.17 
 
 		 127 aa  49.3  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 127 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 127 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 127 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 123 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  25 
 
 		 123 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 127 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 127 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  25 
 
 		 127 aa  49.3  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 127 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5250  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.05 
 
 		 360 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  25 
 
 		 126 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  25.83 
 
 		 129 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 129 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  25.83 
 
 		 129 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  25.83 
 
 		 129 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.05 
 
 		 316 aa  48.9  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  25.83 
 
 		 129 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  25.83 
 
 		 129 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  25.83 
 
 		 129 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  25 
 
 		 127 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  25.83 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  24.17 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 129 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  24.11 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  28.1 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  24.17 
 
 		 127 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  24.76 
 
 		 127 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  29.51 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  25 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2856  response regulator receiver protein  23.33 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2586  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.25 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.340266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  25 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  24.76 
 
 		 129 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  25 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  25 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  25 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  25 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4166  response regulator  22.88 
 
 		 508 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  23.97 
 
 		 1066 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  25 
 
 		 129 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2604  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.5 
 
 		 341 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.224021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>