35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0340 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  59.14 
 
 		 1049 aa  1256    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  46.68 
 
 		 1059 aa  907    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  39.54 
 
 		 1098 aa  742    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 1064 aa  2185    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  31.34 
 
 		 1116 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  30.22 
 
 		 1047 aa  431  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  25.45 
 
 		 1125 aa  212  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  26.67 
 
 		 1176 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  24.12 
 
 		 1100 aa  169  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  25.93 
 
 		 1121 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  23.75 
 
 		 1560 aa  147  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  22.65 
 
 		 1021 aa  144  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  23.71 
 
 		 1636 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  23.41 
 
 		 1005 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  27.79 
 
 		 1024 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  23.26 
 
 		 1632 aa  125  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  24.09 
 
 		 1847 aa  112  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  25.38 
 
 		 1613 aa  102  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  21.19 
 
 		 1609 aa  99  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  23.44 
 
 		 1615 aa  93.6  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  23.44 
 
 		 576 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  23.18 
 
 		 555 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  27.32 
 
 		 1301 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2332  adenine specific DNA methyltransferase  36.15 
 
 		 151 aa  59.3  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0118621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.27 
 
 		 974 aa  58.2  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  27.34 
 
 		 475 aa  57  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  23.2 
 
 		 1063 aa  55.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.56 
 
 		 1041 aa  51.6  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1209 aa  49.7  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1612 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.28 
 
 		 950 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  33.98 
 
 		 1432 aa  45.8  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  26.07 
 
 		 1076 aa  45.4  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  19.26 
 
 		 1020 aa  45.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  28.33 
 
 		 1132 aa  44.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>