More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_03790 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
485 aa  973    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 
487 aa  633  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 
488 aa  623  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 
471 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 
500 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
474 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 
467 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 
465 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 
466 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 
477 aa  498  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
471 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  54 
 
 
464 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
471 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
465 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
471 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 
467 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
469 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 
469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 
463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  52.25 
 
 
465 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
481 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
464 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
459 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
480 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 
473 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
469 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
467 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
470 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 
481 aa  428  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
549 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  43.02 
 
 
588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
451 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
524 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
485 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
481 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
461 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
460 aa  381  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
485 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
459 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
461 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
461 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
460 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
458 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
459 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
459 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
459 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
459 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
460 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
460 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
459 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
461 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
459 aa  372  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
465 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
462 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
480 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43 
 
 
480 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
459 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
459 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
459 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
481 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
454 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
459 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
459 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
461 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
493 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
494 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
461 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
461 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
459 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
461 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
460 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
485 aa  363  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
460 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
487 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
460 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
460 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
461 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
468 aa  360  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
460 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
460 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
460 aa  360  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
456 aa  359  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
505 aa  359  6e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
455 aa  358  8e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
460 aa  358  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
485 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
493 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
459 aa  356  5.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
461 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
487 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>