More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1315 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1116  ribonuclease III  56.06 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0037  ribonuclease III  52.67 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2224  ribonuclease III  46.38 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0167185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0304  ribonuclease III  43.31 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.821127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2170  ribonuclease III  34.01 
 
 		 406 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290031  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1092  ribonuclease III  33.33 
 
 		 409 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0654  ribonuclease III  33.33 
 
 		 409 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.988138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1134  ribonuclease III  33.33 
 
 		 409 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2895  ribonuclease III  33.33 
 
 		 467 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2779  ribonuclease III  33.33 
 
 		 467 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2840  ribonuclease III  33.33 
 
 		 467 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1789  ribonuclease III  33.33 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0543  ribonuclease III  33.33 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2815  ribonuclease III  33.33 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1010  ribonuclease III  33.33 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2466  ribonuclease III  33.33 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  31.65 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1085  ribonuclease III  31.51 
 
 		 428 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1014  ribonuclease III  33.33 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  32.65 
 
 		 408 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  34.04 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1730  ribonuclease III  32.65 
 
 		 469 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2899  ribonuclease III  30.82 
 
 		 418 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.560315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0841  ribonuclease III  32.65 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0650  ribonuclease III  33.33 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.397443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  32.65 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  29.45 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  29.45 
 
 		 248 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  38.35 
 
 		 229 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  33.1 
 
 		 246 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  31.29 
 
 		 256 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  31.29 
 
 		 256 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  32.12 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  34.04 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  31.29 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  31.29 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  29.5 
 
 		 263 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.66 
 
 		 240 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  35.77 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  33.82 
 
 		 234 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  26.39 
 
 		 229 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  30.94 
 
 		 233 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  33.1 
 
 		 246 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  33.57 
 
 		 230 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  26.39 
 
 		 229 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  34.03 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  32.82 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  28.77 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  32.12 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  31.21 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0608  ribonuclease III  36.57 
 
 		 196 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.815667  normal  0.533927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  34.07 
 
 		 229 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  33.82 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  35.11 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  33.82 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  31.85 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  32.37 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  36 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  36 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  34.72 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  30.94 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  34.9 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  33.59 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  34.72 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  30.5 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  25.69 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  30.5 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  30.22 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1493  ribonuclease III  35.17 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000322958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  31.94 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  31.69 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  33.1 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  33.1 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  33.1 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  33.1 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  33.1 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  33.1 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  32.82 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  34.38 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  33.59 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  31.47 
 
 		 246 aa  67.8  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  33.1 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4580  ribonuclease III  36.8 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  33.1 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  32.39 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  30.77 
 
 		 228 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  33.1 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  33.33 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  32.82 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  32.06 
 
 		 226 aa  67  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  32.82 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  33.8 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  34.07 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  31.47 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  28.57 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  31.62 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  31.3 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  30.99 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  29.17 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>