37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1020 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  652    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  50.78 
 
 
322 aa  329  3e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  53.29 
 
 
322 aa  329  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  49.84 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  51.32 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  42.9 
 
 
329 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  43.51 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  42.9 
 
 
301 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  38.46 
 
 
293 aa  222  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  36.44 
 
 
365 aa  209  7e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  38.46 
 
 
295 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  44.31 
 
 
329 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  38.48 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  34.2 
 
 
359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  42.42 
 
 
170 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  30.16 
 
 
774 aa  135  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  25.83 
 
 
410 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  28.11 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  27.03 
 
 
327 aa  96.3  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  33.7 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  26.84 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  28.23 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  50.59 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  25.61 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  31.96 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  30.29 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  29.9 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  52.17 
 
 
186 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  27.05 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  30.81 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  42.05 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  37.5 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  26.18 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  34.58 
 
 
174 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1083  hypothetical protein  35.42 
 
 
252 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.550184  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1285  Protein of unknown function DUF1616  40 
 
 
172 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>