More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1003 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  56.44 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  54.04 
 
 		 236 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  56.64 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  50 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  45.79 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  48.28 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  45.26 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  46.26 
 
 		 230 aa  178  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  47.53 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  46.98 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  47.42 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  39.38 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  46.82 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  39.91 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  39.29 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  37.95 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  39.01 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  37.5 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  39.22 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  35.19 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  33.19 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  37 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  36 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  34.08 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  33.48 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  29.96 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  33.06 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  34.78 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  34.58 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  37.27 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  34.02 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  40.76 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  30.04 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  31.97 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  29.46 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  32.23 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  29.34 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  30.74 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  29.46 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  31.4 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  29.03 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  30.17 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  30.17 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  30.58 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  32.23 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  30.58 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  30.29 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  30.71 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  31.7 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  30.74 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  29.88 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  31.12 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  30.58 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  29.46 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  30.77 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  30 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  30.29 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  30.45 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  30.33 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  31.28 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0530  uridylate kinase  29.51 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  29.51 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  29.75 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  29.8 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  29.05 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  27.16 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  28.16 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  30.45 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  29.39 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  30.08 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  30.29 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  30.08 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  29.11 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  30.49 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  27.8 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  30.2 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  28.4 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  27.39 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  29.05 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  27.8 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  29.46 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  29.05 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  28.86 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  29.05 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  30.62 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  28.4 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  29.03 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13319  predicted protein  32.69 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.494059  normal  0.0799913 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  29.67 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  29.03 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  29.03 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  29.68 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  30.62 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  27.71 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  29.88 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  29.51 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0787  uridylate kinase  31.35 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  29.88 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  28.28 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>