48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0727 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0727  exsB protein  100 
 
 		 1310 aa  2642    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.202441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.3 
 
 		 2145 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  25.31 
 
 		 1180 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 833 aa  68.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31.78 
 
 		 573 aa  67.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.19 
 
 		 1694 aa  66.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1550 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1276 aa  61.6  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 4489 aa  57.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  28.35 
 
 		 773 aa  55.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 301 aa  55.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 602 aa  54.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 329 aa  54.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 344 aa  53.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  21.24 
 
 		 1261 aa  53.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.7 
 
 		 1507 aa  53.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.15 
 
 		 1238 aa  52.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5127  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.45 
 
 		 932 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 784 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.77 
 
 		 1186 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 714 aa  49.7  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 4095 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 955 aa  49.3  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  26.45 
 
 		 807 aa  49.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 377 aa  48.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 409 aa  47.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 543 aa  47.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 4079 aa  48.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 471 aa  47.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 452 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  25.7 
 
 		 1147 aa  47.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 466 aa  47.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1192 aa  47  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 1737 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 448 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 730 aa  47.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 409 aa  46.6  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  26.18 
 
 		 295 aa  46.6  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.17 
 
 		 745 aa  46.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 589 aa  46.6  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  25.08 
 
 		 1044 aa  46.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 375 aa  46.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.26 
 
 		 414 aa  46.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 1297 aa  45.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  26.18 
 
 		 295 aa  45.1  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 562 aa  45.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  23.2 
 
 		 572 aa  45.1  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 409 aa  45.1  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>