63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0230 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  699    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  44.51 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  45.03 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  44.86 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  41.46 
 
 		 331 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  43.83 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  38.65 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  39.32 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  37 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  26.87 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  24.75 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.67 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.69 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  25.64 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  27.62 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  22.82 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  22.47 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  22.94 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  23.45 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1309  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3382  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  22.08 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0194  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2714  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2975  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 414 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.0745419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1336  hypothetical protein  29.41 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00270043  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 404 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1155  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 405 aa  46.2  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00303248  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0176  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1192  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.23 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.052698  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1942  hypothetical protein  26.72 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2262  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.275727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2305  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146682  hitchhiker  0.00602825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2580  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0496  radical SAM family protein  26.61 
 
 		 469 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3540  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1202  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000160208  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03047  elongator protein 3/MiaB/NifB  25.41 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 421 aa  43.5  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4849  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 471 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0393  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 397 aa  42.7  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00226682  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2338  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278935  normal  0.595723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>