More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5987 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008704  Mkms_5987  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129837 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5582  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0423164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5587  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5653  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5431  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  54.69 
 
 		 276 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.15452 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5602  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  54.69 
 
 		 276 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.384176  normal  0.976486 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5828  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  54.69 
 
 		 276 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313966 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6003  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  54.69 
 
 		 276 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000813488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  45.79 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0380  Integrase catalytic region  47.21 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4622  Integrase catalytic region  47.21 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0989982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0741  Integrase catalytic region  47.21 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4080  Integrase catalytic region  47.21 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4235  Integrase catalytic region  47.21 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1404  Integrase catalytic region  47.21 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0981822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1895  Integrase catalytic region  47.21 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.571703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  44.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  44.44 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  48.36 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  48.36 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  54.32 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  54.32 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  46.19 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  48.77 
 
 		 218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  54.32 
 
 		 301 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  54.32 
 
 		 301 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  44.02 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  54.32 
 
 		 301 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  53.7 
 
 		 301 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  45.18 
 
 		 301 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  45.18 
 
 		 301 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  45.18 
 
 		 301 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  52.73 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  52.73 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  52.73 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  52.73 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  52.73 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  46.23 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4646  hypothetical protein  41.1 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2788  integrase catalytic subunit  41.1 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5444  integrase catalytic subunit  41.1 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.724901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  49.7 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3221  integrase catalytic subunit  41.1 
 
 		 375 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0559107  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  50.52 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 311 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  46.73 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  46.73 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  47.15 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  44.86 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  44.86 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  44.86 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  44.86 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  50.6 
 
 		 282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  50.6 
 
 		 282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  49.09 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  50.3 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  41.03 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  44.39 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  44.65 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  49.38 
 
 		 301 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  49.38 
 
 		 301 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  50.92 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  44.22 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  44.22 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0930  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2594  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0806255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0947  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1484  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2638  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220037  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  49.08 
 
 		 304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  47.24 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2753  integrase catalytic subunit  42.02 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5973  integrase catalytic subunit  43.01 
 
 		 219 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  42.92 
 
 		 283 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1592  integrase catalytic subunit  42.16 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3565  integrase catalytic subunit  42.16 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  51.27 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  51.27 
 
 		 296 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  50.63 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  50.63 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  50.63 
 
 		 296 aa  121  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  50.63 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  50.63 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  50.63 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  50.63 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>