42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5523 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  230  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  55.24 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  54.69 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  38.1 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  43.06 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  45.61 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  38.2 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 		 263 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  41.94 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5581  hypothetical protein  66.67 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  38.98 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  42.37 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  40.98 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.46 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  42.05 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  33.73 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 103 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  41.94 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  36.14 
 
 		 94 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  36.14 
 
 		 94 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  37.25 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 103 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  32.58 
 
 		 103 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  39.22 
 
 		 90 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 		 100 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  32.58 
 
 		 103 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>