More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1841 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4327  propionyl-CoA carboxylase  76.51 
 
 
498 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1794  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
498 aa  1008    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1841  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
498 aa  1008    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.151151  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2019  propionyl-CoA carboxylase  78.92 
 
 
498 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1775  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
498 aa  1008    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  39.28 
 
 
514 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  37.15 
 
 
520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  38.06 
 
 
513 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  36.12 
 
 
525 aa  282  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  38.07 
 
 
538 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  35.74 
 
 
514 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  37.88 
 
 
514 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  36.42 
 
 
532 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  36.49 
 
 
508 aa  270  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  36.73 
 
 
521 aa  270  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  34.56 
 
 
516 aa  270  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  34.56 
 
 
516 aa  270  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  32.62 
 
 
514 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  33.01 
 
 
518 aa  264  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  35.41 
 
 
517 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  33.53 
 
 
514 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  34.2 
 
 
516 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  35.21 
 
 
527 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  33.66 
 
 
516 aa  260  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  35.4 
 
 
515 aa  259  7e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  33.33 
 
 
514 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  35.12 
 
 
515 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  33.27 
 
 
516 aa  257  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  37.29 
 
 
513 aa  256  6e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  35.8 
 
 
526 aa  256  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  35.39 
 
 
513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  34.65 
 
 
512 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  35.63 
 
 
517 aa  254  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  35 
 
 
522 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  34.9 
 
 
517 aa  253  8.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  34 
 
 
516 aa  252  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  33.8 
 
 
516 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  33.6 
 
 
516 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  32.6 
 
 
514 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  35.02 
 
 
531 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  36.73 
 
 
529 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  34.72 
 
 
512 aa  250  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  33.99 
 
 
522 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  34.69 
 
 
514 aa  249  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  34.85 
 
 
542 aa  249  9e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  32.39 
 
 
515 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  33.33 
 
 
521 aa  247  3e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  33.73 
 
 
517 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  34.36 
 
 
518 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  32.44 
 
 
564 aa  247  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2974  carboxyl transferase  32.61 
 
 
515 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2593  propionyl-CoA carboxylase  33.94 
 
 
505 aa  246  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  34.3 
 
 
514 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  33.13 
 
 
510 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  34.55 
 
 
517 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1198  carboxyl transferase domain protein  35.15 
 
 
548 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  33.54 
 
 
510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  33.59 
 
 
517 aa  243  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1632  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase component  35.81 
 
 
540 aa  243  5e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  35.15 
 
 
531 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  34.53 
 
 
534 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  35.64 
 
 
532 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  35.52 
 
 
531 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  34.4 
 
 
516 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  32.24 
 
 
513 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  33.47 
 
 
518 aa  240  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  35.54 
 
 
519 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  33.75 
 
 
513 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  33.86 
 
 
523 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  33.08 
 
 
524 aa  239  6.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  33.2 
 
 
516 aa  239  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  34.53 
 
 
530 aa  239  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  32.25 
 
 
517 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1854  propionyl-CoA carboxylase  33.27 
 
 
505 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3419  Propionyl-CoA carboxylase  32.21 
 
 
515 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  35.4 
 
 
527 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  33.99 
 
 
522 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  33.27 
 
 
523 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  33.73 
 
 
516 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  34.34 
 
 
519 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  36.85 
 
 
514 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  34.29 
 
 
516 aa  236  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  35.26 
 
 
527 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  33.46 
 
 
520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  30.4 
 
 
508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  34.73 
 
 
527 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  32.92 
 
 
520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  34.64 
 
 
506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  32.52 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  32.09 
 
 
513 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  35.48 
 
 
516 aa  234  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1342  carboxyl transferase  33.07 
 
 
511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525317  normal  0.223983 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  30.52 
 
 
509 aa  233  6e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  32.09 
 
 
518 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  34.8 
 
 
516 aa  233  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0811  propionyl-CoA carboxylase  31.7 
 
 
555 aa  232  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  33.81 
 
 
522 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1099  propionyl-CoA carboxylase  30.58 
 
 
535 aa  232  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  33.8 
 
 
536 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  31.46 
 
 
513 aa  231  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>