More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0811 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1521  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  70.54 
 
 		 553 aa  768    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.594528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2183  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  72.32 
 
 		 553 aa  775    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.297828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1428  propionyl-CoA carboxylase  59.93 
 
 		 572 aa  660    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.81705  normal  0.150471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0811  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 555 aa  1130    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3654  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  55.15 
 
 		 545 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000718459  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  53.72 
 
 		 560 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  53.23 
 
 		 542 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3637  Propionyl-CoA carboxylase  52.48 
 
 		 537 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2546  propionyl-CoA carboxylase  51.68 
 
 		 542 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08311  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  50 
 
 		 542 aa  547  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.065902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4899  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  52.43 
 
 		 536 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0752  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  52.09 
 
 		 542 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1707  Propionyl-CoA carboxylase  50.64 
 
 		 542 aa  532  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  46.18 
 
 		 554 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  46.36 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12524  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD1  44.78 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  46.31 
 
 		 535 aa  467  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  46.17 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  44.96 
 
 		 541 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.31 
 
 		 533 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  45.45 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1703  propionyl-CoA carboxylase  46.68 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.966803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1729  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.81 
 
 		 529 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0231306  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4091  propionyl-CoA carboxylase  46.17 
 
 		 516 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  45.63 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3852  Propionyl-CoA carboxylase  45.58 
 
 		 539 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.814993  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.72 
 
 		 537 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0147  propionyl-CoA carboxylase  47.31 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  45.68 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  45.7 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  45.12 
 
 		 533 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  44.6 
 
 		 535 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  45.6 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  45.7 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  44.78 
 
 		 535 aa  455  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  45.74 
 
 		 535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2552  propionyl-CoA carboxylase  44.67 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.15771  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  46.74 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  45.13 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  44.15 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1643  propionyl-CoA carboxylase  44.97 
 
 		 537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.552875  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  44.06 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  45.16 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  46.55 
 
 		 535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  46.14 
 
 		 552 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  46.74 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 553 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  44.6 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  43.92 
 
 		 542 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  43.96 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  44.6 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1875  propionyl-CoA carboxylase  45.83 
 
 		 538 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1890  propionyl-CoA carboxylase  45.35 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  45.97 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  46.15 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  45.16 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  45.99 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  44.42 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  44.36 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  43.55 
 
 		 535 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  44.78 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  44.25 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  44.49 
 
 		 526 aa  452  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.642597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  44.42 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6511  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  44.75 
 
 		 536 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819458  normal  0.215888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  46.33 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1403  Propionyl-CoA carboxylase  44.22 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  44.7 
 
 		 536 aa  448  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.45 
 
 		 534 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  43.4 
 
 		 546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  43.41 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  44.19 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  44.6 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3465  propionyl-CoA carboxylase  44.11 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1943  propionyl-CoA carboxylase  44.89 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  45.16 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4377  Propionyl-CoA carboxylase  45.3 
 
 		 536 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0235  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.71 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318135  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  44.24 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0290  carboxyl transferase  45.49 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  43.62 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7689  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta subunit  45.54 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  44.6 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  44.15 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2100  Propionyl-CoA carboxylase  45.81 
 
 		 541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.414224  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  44.42 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  44.22 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  44.39 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  46.29 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  44.18 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  45.78 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  45.5 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  45.13 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  44.2 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  44.04 
 
 		 535 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3631  propionyl-CoA carboxylase  44.74 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2786  propionyl-CoA carboxylase  44.63 
 
 		 538 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  43.54 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3636  propionyl-CoA carboxylase  44.55 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3704  propionyl-CoA carboxylase  44.74 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>