More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1663 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2546  propionyl-CoA carboxylase  63.53 
 
 		 542 aa  743    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  64.6 
 
 		 542 aa  734    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3637  Propionyl-CoA carboxylase  63.83 
 
 		 537 aa  727    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0752  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  62.19 
 
 		 542 aa  720    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08311  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  62.71 
 
 		 542 aa  741    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.065902  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1707  Propionyl-CoA carboxylase  64.64 
 
 		 542 aa  713    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 560 aa  1148    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3654  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  65.47 
 
 		 545 aa  741    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000718459  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4899  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  63.74 
 
 		 536 aa  713    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2183  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  57.25 
 
 		 553 aa  606  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.297828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1521  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  56.23 
 
 		 553 aa  597  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.594528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1428  propionyl-CoA carboxylase  51.81 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.81705  normal  0.150471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0811  propionyl-CoA carboxylase  53.72 
 
 		 555 aa  580  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  53.07 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  50.91 
 
 		 541 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  50.87 
 
 		 554 aa  552  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  52.98 
 
 		 535 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  50.49 
 
 		 535 aa  546  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  52.33 
 
 		 534 aa  542  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  52.31 
 
 		 535 aa  541  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  50.19 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  50.97 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  49.28 
 
 		 537 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1943  propionyl-CoA carboxylase  50.68 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3465  propionyl-CoA carboxylase  50.48 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  50.65 
 
 		 536 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  50.09 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  50.19 
 
 		 535 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  51.45 
 
 		 535 aa  537  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  51.07 
 
 		 535 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  49.16 
 
 		 535 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  53.78 
 
 		 535 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  50.97 
 
 		 552 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  50.39 
 
 		 535 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  51.07 
 
 		 535 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  49.81 
 
 		 535 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  50.78 
 
 		 535 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  50.83 
 
 		 529 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  50.84 
 
 		 535 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.01 
 
 		 542 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  50 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  50.87 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  48.18 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  48.37 
 
 		 535 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  49.34 
 
 		 535 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  48.34 
 
 		 546 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  52.23 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3264  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48 
 
 		 541 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.399585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  50.68 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  50.68 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  51.07 
 
 		 535 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  50.68 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  50.29 
 
 		 535 aa  528  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  50.68 
 
 		 535 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  50.68 
 
 		 535 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  50.68 
 
 		 535 aa  529  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  50.68 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  50.29 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  49.43 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  50.48 
 
 		 535 aa  528  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  48.97 
 
 		 535 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  48.15 
 
 		 553 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  47.42 
 
 		 536 aa  525  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  49.35 
 
 		 534 aa  527  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  48.42 
 
 		 535 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  49.62 
 
 		 535 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1890  propionyl-CoA carboxylase  50.58 
 
 		 535 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  50.48 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  49.52 
 
 		 535 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  49.06 
 
 		 535 aa  528  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.15 
 
 		 526 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.642597  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  49.32 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  46.93 
 
 		 536 aa  527  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1703  propionyl-CoA carboxylase  52.91 
 
 		 535 aa  528  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.966803  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  49.71 
 
 		 535 aa  528  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  48.78 
 
 		 540 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  49.44 
 
 		 536 aa  525  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  49.13 
 
 		 535 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  48.96 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  49.71 
 
 		 535 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  49.13 
 
 		 535 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  49.06 
 
 		 534 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  48.94 
 
 		 535 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  50.19 
 
 		 533 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  50.39 
 
 		 535 aa  525  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  49.9 
 
 		 547 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  46.77 
 
 		 536 aa  523  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0471  propionyl-CoA carboxylase  48.09 
 
 		 535 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  49.13 
 
 		 535 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  49.32 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0930  carboxyl transferase  48.94 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0422748  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  49.13 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  49.13 
 
 		 535 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  48.79 
 
 		 534 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12524  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD1  49.62 
 
 		 529 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  49.25 
 
 		 540 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  48.78 
 
 		 535 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  49.33 
 
 		 534 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1857  propionyl-CoA carboxylase  51.09 
 
 		 535 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0147  propionyl-CoA carboxylase  51.66 
 
 		 503 aa  518  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>