More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2183 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2183  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 553 aa  1123    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.297828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1521  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  82.28 
 
 		 553 aa  934    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.594528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1428  propionyl-CoA carboxylase  60.47 
 
 		 572 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.81705  normal  0.150471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0811  propionyl-CoA carboxylase  72.32 
 
 		 555 aa  792    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  57.12 
 
 		 560 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3654  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  54.76 
 
 		 545 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000718459  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  53.15 
 
 		 542 aa  591  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3637  Propionyl-CoA carboxylase  55.49 
 
 		 537 aa  591  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08311  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  51.57 
 
 		 542 aa  579  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.065902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2546  propionyl-CoA carboxylase  51.76 
 
 		 542 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0752  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  52.13 
 
 		 542 aa  561  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1707  Propionyl-CoA carboxylase  52.3 
 
 		 542 aa  550  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4899  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  51.12 
 
 		 536 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  47.74 
 
 		 554 aa  513  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  50.46 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  47.56 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  46.29 
 
 		 546 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  48.44 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  48.38 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  47.38 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  46.11 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  47.57 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  47.57 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.91 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  47.92 
 
 		 535 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  45.75 
 
 		 535 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  47.83 
 
 		 535 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  46.53 
 
 		 535 aa  498  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1403  Propionyl-CoA carboxylase  47.74 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  47.49 
 
 		 535 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  47.3 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  47.12 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  49.17 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1703  propionyl-CoA carboxylase  48.19 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.966803  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  46.93 
 
 		 535 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  47.3 
 
 		 535 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  46.4 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  48.98 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  45.57 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  46.43 
 
 		 535 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  46.57 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1890  propionyl-CoA carboxylase  47.04 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  48.99 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  47.79 
 
 		 536 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  48.99 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  47.12 
 
 		 535 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  46.47 
 
 		 547 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  47.12 
 
 		 535 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  48.98 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  47.03 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  46.75 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  46.77 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  46.75 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  46.75 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  46.24 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  46.75 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  46.75 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  46.75 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  48.62 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12524  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD1  47.33 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  46.42 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  46.58 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1532  propionyl-CoA carboxylase  47.89 
 
 		 532 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  47.89 
 
 		 533 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  46.75 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.97 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  47.12 
 
 		 534 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  48.24 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  46.15 
 
 		 553 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  45.69 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0737  propionyl-CoA carboxylase  48.43 
 
 		 534 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  46.76 
 
 		 534 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.89 
 
 		 529 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  46.61 
 
 		 535 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  48.46 
 
 		 535 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  48.28 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  47.41 
 
 		 535 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  48.28 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3465  propionyl-CoA carboxylase  46.42 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1875  propionyl-CoA carboxylase  46.92 
 
 		 538 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  47.62 
 
 		 541 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.68 
 
 		 542 aa  485  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1643  propionyl-CoA carboxylase  47.56 
 
 		 537 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.552875  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  46.03 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  45.87 
 
 		 534 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.66 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  47.22 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  46.86 
 
 		 533 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  47.04 
 
 		 535 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  46.76 
 
 		 534 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  46.57 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  46.4 
 
 		 540 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  47.22 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  46.84 
 
 		 535 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  47.31 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  47.38 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  47.28 
 
 		 535 aa  478  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  47.49 
 
 		 535 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6511  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.79 
 
 		 536 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819458  normal  0.215888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  46.84 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>