More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3654 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3637  Propionyl-CoA carboxylase  68.04 
 
 		 537 aa  788    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3654  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 545 aa  1128    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000718459  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1707  Propionyl-CoA carboxylase  70.28 
 
 		 542 aa  794    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2546  propionyl-CoA carboxylase  70.19 
 
 		 542 aa  800    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4899  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  69.59 
 
 		 536 aa  776    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  65.47 
 
 		 560 aa  741    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  72.59 
 
 		 542 aa  837    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0752  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  67.53 
 
 		 542 aa  776    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08311  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  68.52 
 
 		 542 aa  788    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.065902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1428  propionyl-CoA carboxylase  53.1 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.81705  normal  0.150471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0811  propionyl-CoA carboxylase  55.15 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2183  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  54.76 
 
 		 553 aa  590  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.297828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1521  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  54.07 
 
 		 553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.594528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  51.74 
 
 		 535 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  51.76 
 
 		 536 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  51.58 
 
 		 536 aa  559  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  53.04 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  52.13 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  50.46 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  50.46 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  51.87 
 
 		 540 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  51.21 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  51.21 
 
 		 535 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  51.21 
 
 		 535 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  49.72 
 
 		 535 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  50.09 
 
 		 535 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  50.18 
 
 		 541 aa  552  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  51.59 
 
 		 535 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  50.28 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  50.65 
 
 		 535 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  51.21 
 
 		 535 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  51.4 
 
 		 535 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  51.21 
 
 		 535 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  49.91 
 
 		 535 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  50.09 
 
 		 535 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  50.09 
 
 		 535 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  51.21 
 
 		 535 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  52.48 
 
 		 535 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  49.91 
 
 		 554 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  51.4 
 
 		 535 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 534 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  50.64 
 
 		 535 aa  551  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  50.28 
 
 		 534 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  50.46 
 
 		 535 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  49.54 
 
 		 546 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  49.54 
 
 		 535 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1890  propionyl-CoA carboxylase  49.91 
 
 		 535 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  51.59 
 
 		 536 aa  547  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1943  propionyl-CoA carboxylase  49.17 
 
 		 535 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  50.09 
 
 		 537 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  50.09 
 
 		 553 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 552 aa  545  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  50.85 
 
 		 535 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  50 
 
 		 540 aa  548  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0930  carboxyl transferase  50.65 
 
 		 535 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0422748  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  50.46 
 
 		 535 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  49.91 
 
 		 535 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  49.53 
 
 		 535 aa  544  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  49.54 
 
 		 535 aa  545  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  50.18 
 
 		 533 aa  545  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  50.09 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  49.91 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3264  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.69 
 
 		 541 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.399585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  49.54 
 
 		 535 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4160  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.27 
 
 		 542 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  49.82 
 
 		 535 aa  545  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  52.11 
 
 		 535 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  50.28 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  49.54 
 
 		 535 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  51.34 
 
 		 534 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  49.54 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  50.47 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  50.47 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  50.19 
 
 		 535 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  49.54 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  50.47 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  49.91 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  49.36 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  49.54 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  50.46 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  50.47 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  49.18 
 
 		 540 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  49.17 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  48.81 
 
 		 547 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  49.36 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001542  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  50.55 
 
 		 534 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  49.17 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  49.36 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  48.9 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  48.07 
 
 		 534 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  49.36 
 
 		 535 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>