More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3637 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3637  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 537 aa  1105    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3654  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  68.04 
 
 		 545 aa  788    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000718459  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4899  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  73.73 
 
 		 536 aa  805    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2546  propionyl-CoA carboxylase  69.13 
 
 		 542 aa  773    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  72.9 
 
 		 542 aa  807    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1707  Propionyl-CoA carboxylase  68.11 
 
 		 542 aa  742    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  63.83 
 
 		 560 aa  727    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08311  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  69.27 
 
 		 542 aa  779    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.065902  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0752  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  68.41 
 
 		 542 aa  771    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1428  propionyl-CoA carboxylase  53.43 
 
 		 572 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.81705  normal  0.150471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2183  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  55.49 
 
 		 553 aa  588  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.297828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1521  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  54.93 
 
 		 553 aa  574  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.594528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0811  propionyl-CoA carboxylase  52.48 
 
 		 555 aa  553  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  49.81 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  49.05 
 
 		 535 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  47.48 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  48.09 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1943  propionyl-CoA carboxylase  47.62 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  47.54 
 
 		 554 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  46.58 
 
 		 535 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  46.58 
 
 		 535 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  47.24 
 
 		 541 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.21 
 
 		 533 aa  498  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  47.88 
 
 		 534 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  47.16 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  46.59 
 
 		 537 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  47.8 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1890  propionyl-CoA carboxylase  47.13 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3465  propionyl-CoA carboxylase  48.59 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  48.18 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.98 
 
 		 535 aa  498  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  48.74 
 
 		 535 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  47.59 
 
 		 535 aa  492  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  46.73 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3264  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.71 
 
 		 541 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.399585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  47.35 
 
 		 533 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  45.97 
 
 		 535 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  45.97 
 
 		 534 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  45.79 
 
 		 547 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  46.55 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  45.88 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3631  propionyl-CoA carboxylase  46.78 
 
 		 516 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  47.78 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3704  propionyl-CoA carboxylase  46.78 
 
 		 516 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000378  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  46.77 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.723902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.18 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  46.36 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3636  propionyl-CoA carboxylase  46.59 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  46.68 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  45.98 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  46.36 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  47.86 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  46.79 
 
 		 536 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  47.06 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  47.14 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05479  propionyl-CoA carboxylase subunit beta  46.93 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  47.97 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  47.06 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  47.44 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  45.44 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  46.55 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  45.7 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  46.87 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.05 
 
 		 526 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.642597  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  45.08 
 
 		 536 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4047  propionyl-CoA carboxylase  45.64 
 
 		 553 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257974  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  47.3 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  46.72 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2934  propionyl-CoA carboxylase  45.78 
 
 		 534 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.126477  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6511  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.73 
 
 		 536 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819458  normal  0.215888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  45.22 
 
 		 534 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  46.49 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  46.87 
 
 		 535 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12524  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD1  47.59 
 
 		 529 aa  488  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  45.4 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0930  carboxyl transferase  46.7 
 
 		 535 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0422748  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  46.85 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2552  propionyl-CoA carboxylase  46.21 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.15771  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  46.85 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  45.25 
 
 		 535 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  46.1 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  46.67 
 
 		 553 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  47.1 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  46.46 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001542  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  46.4 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1605  carboxyl transferase  46.72 
 
 		 534 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.811146  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  45.79 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  47.1 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  46.55 
 
 		 536 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  46.72 
 
 		 552 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  44.89 
 
 		 536 aa  482  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  45.4 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  46.85 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  46.87 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  46.2 
 
 		 547 aa  485  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  45.4 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4091  propionyl-CoA carboxylase  45.34 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1729  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.94 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0231306  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  46.53 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  45.21 
 
 		 535 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>