More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1707 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08311  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  79.15 
 
 		 542 aa  913    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.065902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  72.14 
 
 		 542 aa  829    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  62.9 
 
 		 560 aa  728    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4899  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  68.23 
 
 		 536 aa  747    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3654  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  70.28 
 
 		 545 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000718459  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1707  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 542 aa  1116    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0752  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  70.24 
 
 		 542 aa  795    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3637  Propionyl-CoA carboxylase  67.37 
 
 		 537 aa  755    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2546  propionyl-CoA carboxylase  80.07 
 
 		 542 aa  921    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1428  propionyl-CoA carboxylase  50.64 
 
 		 572 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.81705  normal  0.150471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1521  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  52.96 
 
 		 553 aa  561  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.594528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2183  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  52.3 
 
 		 553 aa  560  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.297828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0811  propionyl-CoA carboxylase  51.77 
 
 		 555 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 541 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  51.61 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  50.76 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  51.7 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.98 
 
 		 537 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 536 aa  536  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  49.91 
 
 		 535 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  49.72 
 
 		 536 aa  534  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  50.57 
 
 		 535 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1943  propionyl-CoA carboxylase  49.34 
 
 		 535 aa  535  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  50.66 
 
 		 535 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  49.91 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3264  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.77 
 
 		 541 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.399585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  48.77 
 
 		 535 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  49.53 
 
 		 534 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  49.53 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  50.38 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  50.38 
 
 		 535 aa  525  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  48.24 
 
 		 554 aa  528  1e-148  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.26 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  50.87 
 
 		 534 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 552 aa  527  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4047  propionyl-CoA carboxylase  50.1 
 
 		 553 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257974  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  50 
 
 		 547 aa  528  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  50.38 
 
 		 535 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  49.72 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  50.09 
 
 		 535 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  50.57 
 
 		 535 aa  527  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  50.29 
 
 		 533 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  49.63 
 
 		 547 aa  527  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  50.38 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  50.38 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  48.98 
 
 		 535 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  49.81 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  49.63 
 
 		 533 aa  524  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  49.53 
 
 		 535 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  47.87 
 
 		 535 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  49.91 
 
 		 536 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  50.58 
 
 		 535 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  49.53 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1890  propionyl-CoA carboxylase  49.53 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  50 
 
 		 535 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  48.58 
 
 		 535 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  49.34 
 
 		 534 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  48.05 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  50.38 
 
 		 535 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0930  carboxyl transferase  50.38 
 
 		 535 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0422748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  49.62 
 
 		 534 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  49.91 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  48.77 
 
 		 535 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.86 
 
 		 529 aa  522  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  47.69 
 
 		 535 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  50.39 
 
 		 535 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  48.77 
 
 		 535 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1403  Propionyl-CoA carboxylase  49.81 
 
 		 535 aa  521  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1605  carboxyl transferase  50.19 
 
 		 534 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.811146  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  48.86 
 
 		 535 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2552  propionyl-CoA carboxylase  49.05 
 
 		 516 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.15771  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  50 
 
 		 535 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  48.2 
 
 		 535 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  49.17 
 
 		 536 aa  521  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  49.53 
 
 		 553 aa  521  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  49.52 
 
 		 535 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  49.62 
 
 		 540 aa  519  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  47.69 
 
 		 535 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2808  Propionyl-CoA carboxylase  50.38 
 
 		 534 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  49.34 
 
 		 535 aa  518  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  48.48 
 
 		 535 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  51.89 
 
 		 535 aa  521  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  51.33 
 
 		 535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  49.62 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  48.3 
 
 		 546 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3852  Propionyl-CoA carboxylase  49.07 
 
 		 539 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.814993  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3636  propionyl-CoA carboxylase  48.86 
 
 		 516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3704  propionyl-CoA carboxylase  49.05 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  48.71 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  48.4 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  49.63 
 
 		 535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4091  propionyl-CoA carboxylase  49.05 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  48.48 
 
 		 535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3631  propionyl-CoA carboxylase  49.05 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  49.44 
 
 		 535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  48.48 
 
 		 535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  49.81 
 
 		 535 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4160  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 		 535 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>