More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0752 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2546  propionyl-CoA carboxylase  70.85 
 
 		 542 aa  804    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  62.19 
 
 		 560 aa  720    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08311  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  71.72 
 
 		 542 aa  817    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.065902  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1707  Propionyl-CoA carboxylase  70.24 
 
 		 542 aa  778    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3654  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  67.53 
 
 		 545 aa  776    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000718459  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3637  Propionyl-CoA carboxylase  68.41 
 
 		 537 aa  771    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4899  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  70.15 
 
 		 536 aa  768    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0752  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  100 
 
 		 542 aa  1115    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  72.69 
 
 		 542 aa  839    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1428  propionyl-CoA carboxylase  53.14 
 
 		 572 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.81705  normal  0.150471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2183  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  52.13 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.297828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1521  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  52.96 
 
 		 553 aa  552  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.594528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0811  propionyl-CoA carboxylase  52.09 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  50.28 
 
 		 535 aa  537  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  50.88 
 
 		 535 aa  532  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  50 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  47.77 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  47.96 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  47.77 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  49.16 
 
 		 537 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  48.58 
 
 		 541 aa  521  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  48.2 
 
 		 547 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  48.2 
 
 		 536 aa  521  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  48.29 
 
 		 535 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  47.63 
 
 		 536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  48.6 
 
 		 536 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  48.39 
 
 		 534 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  48.01 
 
 		 535 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  47.1 
 
 		 535 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  47.82 
 
 		 535 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1890  propionyl-CoA carboxylase  49.34 
 
 		 535 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  48.47 
 
 		 535 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.41 
 
 		 533 aa  515  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  47.85 
 
 		 535 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.77 
 
 		 529 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  49.06 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  47.85 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  47.85 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  48.11 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  47.85 
 
 		 554 aa  510  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  47.15 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3465  propionyl-CoA carboxylase  48.54 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1943  propionyl-CoA carboxylase  46.49 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  47.48 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  47.66 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  49.43 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  48.39 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  48.41 
 
 		 536 aa  511  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3264  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.39 
 
 		 541 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.399585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  47.82 
 
 		 534 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  47.1 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  48.01 
 
 		 534 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  47.85 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  47.29 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  46.96 
 
 		 546 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  47.48 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  47.44 
 
 		 534 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  47.06 
 
 		 534 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  46.73 
 
 		 535 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.61 
 
 		 534 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  46.73 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  47.91 
 
 		 533 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  47.91 
 
 		 547 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  47.1 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.18 
 
 		 542 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1605  carboxyl transferase  48.01 
 
 		 534 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.811146  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  47.1 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  46.92 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  46.73 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  47.1 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  47.1 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  47.1 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  46.73 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  46.73 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  49.12 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  47.1 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  47.48 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  46.73 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  46.92 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  47.24 
 
 		 535 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  46.92 
 
 		 535 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4047  propionyl-CoA carboxylase  47.62 
 
 		 553 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257974  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2934  propionyl-CoA carboxylase  47.82 
 
 		 534 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.126477  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  46.47 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  47.06 
 
 		 553 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1729  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  50 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0231306  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  48.29 
 
 		 535 aa  499  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1403  Propionyl-CoA carboxylase  48.1 
 
 		 535 aa  500  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  47.48 
 
 		 535 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  47.1 
 
 		 535 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0147  propionyl-CoA carboxylase  49.22 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  47.68 
 
 		 533 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  47 
 
 		 535 aa  495  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6511  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.25 
 
 		 536 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819458  normal  0.215888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  46.79 
 
 		 540 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  46.36 
 
 		 535 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  46.73 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  47.53 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2808  Propionyl-CoA carboxylase  48.01 
 
 		 534 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1857  propionyl-CoA carboxylase  47.75 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>