More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1521 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2183  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  82.28 
 
 		 553 aa  931    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.297828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1428  propionyl-CoA carboxylase  58.53 
 
 		 572 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.81705  normal  0.150471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0811  propionyl-CoA carboxylase  71.4 
 
 		 555 aa  788    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1521  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 553 aa  1123    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.594528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1663  Propionyl-CoA carboxylase  56.23 
 
 		 560 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3654  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  54.07 
 
 		 545 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000718459  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1612  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  53.15 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3637  Propionyl-CoA carboxylase  54.93 
 
 		 537 aa  578  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08311  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  51.85 
 
 		 542 aa  575  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.065902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2546  propionyl-CoA carboxylase  52.78 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0752  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  52.96 
 
 		 542 aa  565  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1707  Propionyl-CoA carboxylase  52.96 
 
 		 542 aa  555  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4899  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  52.85 
 
 		 536 aa  532  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  46.01 
 
 		 554 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  48.19 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  48.44 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1403  Propionyl-CoA carboxylase  47.38 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  47.82 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  48.38 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  46.04 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  47.82 
 
 		 535 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  48.65 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  48.38 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.15 
 
 		 533 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1703  propionyl-CoA carboxylase  47.2 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.966803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  47.57 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  45.94 
 
 		 535 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  45.65 
 
 		 535 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  47.29 
 
 		 535 aa  487  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  46.86 
 
 		 547 aa  488  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  47.58 
 
 		 535 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  46.04 
 
 		 535 aa  485  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  47.32 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 546 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  45.2 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  45.75 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  47.22 
 
 		 541 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1643  propionyl-CoA carboxylase  46.58 
 
 		 537 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.552875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3465  propionyl-CoA carboxylase  45.86 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  45.9 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  46.69 
 
 		 535 aa  478  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  45.52 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  46.36 
 
 		 533 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  45.88 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  46.39 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  46.61 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.84 
 
 		 529 aa  477  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  45.7 
 
 		 535 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  46.03 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  46.21 
 
 		 535 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12524  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD1  46.07 
 
 		 529 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  46.22 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  44.81 
 
 		 535 aa  475  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  44.5 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  46.61 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  45.85 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  46.57 
 
 		 535 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  47.29 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  46.39 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0235  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.41 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318135  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  45.89 
 
 		 553 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  46.39 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.25 
 
 		 542 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  46.43 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  46.43 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  45.67 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  45.7 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  46.39 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  46.43 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  46.61 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  46.43 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  45.31 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  46.43 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  45.96 
 
 		 535 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  46.04 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  46.25 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  45.68 
 
 		 536 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  45.08 
 
 		 535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1729  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.82 
 
 		 529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0231306  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  44.95 
 
 		 535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1890  propionyl-CoA carboxylase  45.41 
 
 		 535 aa  472  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  45.44 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  45.85 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  45.13 
 
 		 535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  45.2 
 
 		 534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  45.99 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6511  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.72 
 
 		 536 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819458  normal  0.215888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  45.13 
 
 		 534 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  45.69 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6413  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.38 
 
 		 522 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0804402  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.53 
 
 		 534 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  44.67 
 
 		 534 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  45.02 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  44.62 
 
 		 536 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  46.96 
 
 		 533 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  45.23 
 
 		 534 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  46.61 
 
 		 535 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3852  Propionyl-CoA carboxylase  46.49 
 
 		 539 aa  468  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.814993  normal  0.205657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>