136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4339 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 		 70 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 		 70 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 		 70 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  78.26 
 
 		 69 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  75.76 
 
 		 70 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  76.56 
 
 		 70 aa  97.1  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  66.18 
 
 		 85 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.35 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  68.42 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  63.08 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  59.38 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.67 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60.71 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  64.81 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.62 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.34 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  53.23 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.62 
 
 		 82 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.62 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  65.31 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.62 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.25 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  52.46 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.41 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  65.22 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.54 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  52.73 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.23 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.88 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  56.6 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  50 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.39 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  50.91 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.62 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.43 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  55.1 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.27 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.07 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12190  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.3 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1731  Exonuclease VII small subunit  40.28 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.735568  normal  0.0195932 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.07 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.82 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.82 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.07 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.93 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.79 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.72 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.28 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  42.86 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.29 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.81 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.38 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.08 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  37.29 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.07 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.92 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.38 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.1 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06260  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.51 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0413231  normal  0.0182875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.92 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.14 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.29 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.92 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.92 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0881  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.81 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.33 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.54 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>