239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4991 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4991  UspA domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  68.05 
 
 
266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  49.43 
 
 
272 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  46.44 
 
 
279 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  46.44 
 
 
279 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  46.07 
 
 
279 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  41.24 
 
 
299 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  41.24 
 
 
299 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  41.24 
 
 
299 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 
274 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2549  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422088  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13155  hypothetical protein  43.13 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.955423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4127  hypothetical protein  36.05 
 
 
261 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4202  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
261 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4358  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12065  hypothetical protein  33.7 
 
 
279 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.1 
 
 
299 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.69 
 
 
284 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  31.02 
 
 
301 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 
293 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  32.25 
 
 
315 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
289 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.04 
 
 
341 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.64 
 
 
341 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.64 
 
 
341 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.77 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  30.21 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  30.21 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  30.21 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.11 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.67 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  29.17 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  29.55 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1381  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.936765  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4995  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
288 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  29.64 
 
 
293 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  33.02 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  27.76 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  34.76 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  29.65 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  28.4 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  29.28 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  30.15 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  29.39 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  29.39 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  29.39 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  32.05 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  38.2 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  27.53 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  27.53 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  35.26 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  29.69 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  27.18 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  32.52 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  31.3 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  31.84 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  32.59 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  28.04 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  30.3 
 
 
288 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  29.57 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  29.96 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  30.49 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  35.12 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  32.46 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  30.74 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.49 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  33.19 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  33.12 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  27.47 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  29.57 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  37.14 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  30.83 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  28.86 
 
 
347 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  39.1 
 
 
275 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  27.19 
 
 
341 aa  62.4  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  35.62 
 
 
155 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0344  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  32.02 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>