More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0980 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  72.95 
 
 
453 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  73.94 
 
 
450 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
455 aa  909    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  72.73 
 
 
453 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  72.73 
 
 
453 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  58.3 
 
 
476 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  55.85 
 
 
471 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  56.55 
 
 
470 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  55.46 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  51.44 
 
 
452 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  51.21 
 
 
454 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  51.66 
 
 
452 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.34 
 
 
456 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  51.24 
 
 
478 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  52.29 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.67 
 
 
453 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  39.46 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 
466 aa  249  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  38.5 
 
 
471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 
469 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 
451 aa  236  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 
480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.76 
 
 
480 aa  233  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  35.76 
 
 
464 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.08 
 
 
476 aa  230  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
467 aa  229  8e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  32.33 
 
 
472 aa  229  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 
460 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  33.25 
 
 
456 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 
459 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 
467 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 
470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 
463 aa  213  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34.89 
 
 
459 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  35.6 
 
 
461 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  35.39 
 
 
484 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.87 
 
 
478 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 
459 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 
459 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
444 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.02 
 
 
478 aa  206  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
444 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  30.11 
 
 
484 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  30.11 
 
 
484 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.89 
 
 
478 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
478 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.42 
 
 
455 aa  203  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  29.03 
 
 
478 aa  203  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 
459 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.26 
 
 
459 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 
459 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.68 
 
 
478 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  35.57 
 
 
472 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  29.53 
 
 
442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
466 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 
476 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
470 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
617 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  33.94 
 
 
479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 
470 aa  196  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
450 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
471 aa  192  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.63 
 
 
502 aa  192  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 
471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.17 
 
 
472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 
470 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.73 
 
 
471 aa  187  4e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  30.84 
 
 
450 aa  186  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  31.7 
 
 
457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 
444 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.95 
 
 
470 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
469 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  34.02 
 
 
462 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  31.78 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  27.56 
 
 
442 aa  176  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
453 aa  170  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  26.68 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.67 
 
 
471 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
480 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
489 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  34.68 
 
 
244 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.91 
 
 
243 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  33.94 
 
 
251 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
246 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
243 aa  106  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 
243 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  28.44 
 
 
244 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
243 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.1 
 
 
346 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  28.33 
 
 
354 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
378 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  35.86 
 
 
242 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  32.2 
 
 
246 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  32.2 
 
 
246 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  29.5 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>