More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl534 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl534  multidrug/protein/lipid ABC transporter ATP-binding component  100 
 
 
659 aa  1342    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.483013  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0538  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  51.86 
 
 
623 aa  641    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.033802  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl423  multidrug ABC transporter  46.63 
 
 
614 aa  541  9.999999999999999e-153  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00524673  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl422  multidrug ABC transporter  45.35 
 
 
610 aa  529  1e-149  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0537  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  44.42 
 
 
617 aa  419  1e-116  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.68995  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl533  multidrug ABC transporter  38.43 
 
 
635 aa  394  1e-108  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  37.21 
 
 
566 aa  297  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 
566 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.06 
 
 
579 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.46 
 
 
571 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.27 
 
 
571 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
571 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.83 
 
 
571 aa  286  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.27 
 
 
571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.27 
 
 
571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.46 
 
 
571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  33.27 
 
 
571 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 
571 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.32 
 
 
596 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.65 
 
 
580 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  32.88 
 
 
589 aa  271  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  30.87 
 
 
615 aa  271  4e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.92 
 
 
582 aa  267  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  33.08 
 
 
586 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.54 
 
 
598 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.82 
 
 
578 aa  265  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.14 
 
 
556 aa  264  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.82 
 
 
578 aa  265  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.36 
 
 
601 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.01 
 
 
578 aa  262  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  31.9 
 
 
610 aa  262  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.44 
 
 
587 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  32.2 
 
 
610 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.48 
 
 
584 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.2 
 
 
609 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  32.34 
 
 
576 aa  260  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.75 
 
 
572 aa  259  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  31.96 
 
 
636 aa  259  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  31.4 
 
 
582 aa  259  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  31.75 
 
 
572 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  31.75 
 
 
572 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.93 
 
 
584 aa  258  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  29.59 
 
 
597 aa  258  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2828  ABC transporter, ATPase subunit  32.15 
 
 
618 aa  257  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  33.4 
 
 
567 aa  257  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  30.62 
 
 
586 aa  256  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  30.83 
 
 
601 aa  256  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  31.84 
 
 
582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  31.37 
 
 
598 aa  254  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  31.09 
 
 
572 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.82 
 
 
567 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  32.48 
 
 
594 aa  254  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.04 
 
 
572 aa  253  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  31.68 
 
 
586 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  30.78 
 
 
581 aa  253  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  35.67 
 
 
575 aa  253  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.46 
 
 
572 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  33.4 
 
 
603 aa  252  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.36 
 
 
608 aa  251  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  31.59 
 
 
650 aa  250  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.91 
 
 
625 aa  250  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.62 
 
 
575 aa  250  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 
589 aa  250  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.57 
 
 
593 aa  250  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  31.19 
 
 
582 aa  250  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  35.28 
 
 
468 aa  249  9e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  31.17 
 
 
644 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.8 
 
 
597 aa  249  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  31.32 
 
 
598 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  31.24 
 
 
660 aa  248  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  31.11 
 
 
568 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  30.75 
 
 
638 aa  248  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  28.93 
 
 
631 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  31.68 
 
 
585 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.72 
 
 
586 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  32.68 
 
 
597 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  30.39 
 
 
634 aa  246  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.9 
 
 
609 aa  246  9e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.53 
 
 
602 aa  246  9e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.06 
 
 
591 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.21 
 
 
598 aa  246  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.34 
 
 
614 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  32.17 
 
 
612 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.4 
 
 
586 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  31.48 
 
 
782 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  31.3 
 
 
623 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  32.29 
 
 
598 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  31.86 
 
 
590 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  30.96 
 
 
658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.73 
 
 
619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  30.43 
 
 
590 aa  244  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3580  ABC transporter related  33.08 
 
 
607 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.01 
 
 
580 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  29.96 
 
 
576 aa  244  5e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.21 
 
 
586 aa  244  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.53 
 
 
586 aa  244  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.21 
 
 
586 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  31.8 
 
 
648 aa  244  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>